Το Διοικητικό Συμβούλιο αποτελεί το κύριο διοικητικό όργανο του Εκκολαπτηρίου. Έχει επταμελή σύνθεση και προεδρεύεται από το Δρ Ανδρέα Ελευθεριάδη, Πρόεδρο του Διοικητικού Συμβουλίου του Cyprus College. Η πλήρης σύνθεση του ΔΣ είναι η ακόλουθη:

1.   Δρ Ανδρέας Ελευθεριάδης (Πρόεδρος ΔΣ, Cyprus College) – Πρόεδρος

2.   Ευριπίδης Πολυκάρπου (Διευθυντής Γραφείου Προέδρου ΔΣ, Cyprus College)

3.   Χριστόφορος Χατζηκυπριανού (Διευθυντής Σχεδιασμού και Ανάπτυξης, Cyprus College)

4.   Κώστας Σεραφείμ (Οικονομικός Διευθυντής, Cyprus College)

5.   Δρ Αλέξανδρος Μιχαηλίδης (Γενικός Διευθυντής, Αναπτυξιακός Οργανισμός ΤΑΛΩΣ)

6.   Αρτέμης Σαϊτάκης (Διευθυντής, Επιστημονικό & Τεχνολογικό Πάρκο Κρήτης)

7.   Χρήστος Κωνσταντίνου (Διευθυντής, SpiderNet)